一直以来，假面骑士和超级战队守护着地球的和平，但这段历史即将被颠覆。假面骑士Decade成为“大修卡”的大首领向超级战队发动进攻，豪快红亦成为“大残虐”的大帝王对决假面骑士。而在两个组织的干部口中，提及着神秘的“大机器计划”……为了搞清楚这场战争的来龙去脉，假面骑士Fourze和Go-Busters乘坐Den-Liner回到过去……...

故事发生在被天空之壁分为三区块的《幪面超人BUILD》的世界，竟然出现了《幪面超人EX-AID》世界的敌人怪人崩源体：为何不该出现在这的敌人会来到这世界？面对神秘敌人而毫无应对方法的战兔，一个身体半边被金属覆盖的神神秘男人出现在他眼前。自称科学家的男人启动了巨大的机器，上空竟出现了倒立的另一个世界。另一边，EX-AID的世界也发生同样的状况。有天空之壁的世界正逐渐的坠落到EX-AID的世界，距离两...